丘巨源，南北朝。南朝齐兰陵人。少举丹阳郡孝廉。宋孝武帝大明五年，助徐爱撰宋之国史。宋明帝即位，使参诏诰，引在左右。历佐诸王府，官至羽林监。入齐，拜武昌太守，不乐。萧鸾(齐明帝)为吴兴太守，巨源作《秋胡诗》，有讥刺语，以事见杀。以才学知名。原有集，已佚。

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